Si lo has instalado en ubuntu y viene por defecto en idioma anglosajón, para conseguir que esté en castellano simplemente abre un terminal y escribe:
sudo apt-get install filezilla-locales
O vía Synaptic busca el paquete filezilla-locales e instálalo. La próxima vez que inicies Filezilla, el programa se cargará en Español (o tu idioma predeterminado).